Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms