Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms