Protein–RNA interactions for Protein: Q96SQ7

ATOH8, Protein atonal homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH8Q96SQ7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATOH8Q96SQ7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms