Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PCNX1Q96RV3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PCNX1Q96RV3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms