Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB3IPQ96QF0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB3IPQ96QF0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms