Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPR78Q96P69 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms