Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HDAC11Q96DB2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms