Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATL1Q8WXF7 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms