Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NEDD1Q8NHV4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NEDD1Q8NHV4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms