Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TCF23Q7RTU1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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