Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRIG3Q6UXM1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRIG3Q6UXM1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms