Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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ZBED9Q6R2W3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZBED9Q6R2W3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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