Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LRRC8EQ6NSJ5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms