Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FAM46CQ5VWP2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms