Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALFQ53S48 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms