Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BOLA3Q53S33 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms