Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RNPC3-202ENST00000524631 2013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ANKRD39Q53RE8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms