Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC38Q502W7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms