Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYTL3Q4VX76 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYTL3Q4VX76 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms