Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC153Q494R4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms