Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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CCDC142Q17RM4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC142Q17RM4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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