Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLPPQ16740 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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