Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDKN3Q16667 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDKN3Q16667 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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