Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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ECM1Q16610 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ECM1Q16610 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
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ECM1Q16610 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ECM1Q16610 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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