Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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SGCAQ16586 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SGCAQ16586 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
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