Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCBQ16585 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCBQ16585 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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