Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
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ZFHX3Q15911 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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ZFHX3Q15911 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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ZFHX3Q15911 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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ZFHX3Q15911 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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ZFHX3Q15911 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ZFHX3Q15911 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ZFHX3Q15911 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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ZFHX3Q15911 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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