Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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