Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 AC114296.1-202ENST00000638019 771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RYR3Q15413 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 VSTM1-205ENST00000425006 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RYR3Q15413 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms