Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TLR1Q15399 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms