Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LAPTM4AQ15012 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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LAPTM4AQ15012 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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LAPTM4AQ15012 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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LAPTM4AQ15012 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LAPTM4AQ15012 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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