Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB39AQ14964 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms