Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GTF2H3Q13889 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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GTF2H3Q13889 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GTF2H3Q13889 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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