Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TUBB2AQ13885 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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