Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TUBA3CQ13748 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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TUBA3CQ13748 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TUBA3CQ13748 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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TUBA3CQ13748 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TUBA3CQ13748 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TUBA3CQ13748 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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