Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTCH1Q13635 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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