Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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DNASE1L3Q13609 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNASE1L3Q13609 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms