Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PEX6Q13608 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PEX6Q13608 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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PEX6Q13608 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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