Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C1orf61Q13536 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C1orf61Q13536 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms