Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BFSP2Q13515 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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