Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PRDM2Q13029 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM2Q13029 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
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