Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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