Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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BNIP1Q12981 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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BNIP1Q12981 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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BNIP1Q12981 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
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BNIP1Q12981 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BNIP1Q12981 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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BNIP1Q12981 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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