Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SYCNQ0VAF6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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