Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNA1Q09470 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms