Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LOXL1Q08397 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms