Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NOTCH2Q04721 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NOTCH2Q04721 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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