Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPCQ03188 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms