Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SRSF2Q01130 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms