Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
HERVK_113P61574 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
HERVK_113P61574 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms